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마이크로바이옴(Microbiome) 워크플로우 추천 제품 이미지

마이크로바이옴(Microbiome) 워크플로우 추천 제품

Maker : MPBIO, TOCRIS, SiTOOLS

마이크로바이옴 연구에 사용할 수 있는 DNA 추출키트, 미생물 rRNA 제거시약, 박테리아 이미징 dye, Viability PCR등을 소개합니다.

마이크로바이옴(Microbiome)이란?


마이크로바이옴은 특정 환경 내에 존재하는 미생물 군집(Microbiota)과 이들이 가진 유전 정보 전체(Genome)를 통합적으로 지칭하는 용어입니다. 현대 생물학에서는 인간을 단일 종의 유기체가 아닌, 미생물과 긴밀한 상호작용을 주고받는 통합 유기체(Holobiont)로 규정하고 있습니다.


마이크로바이옴은 인체의 대사 경로 및 면역 항상성 유지에 핵심적인 역할을 수행하며, 미생물 불균형 (디스바이오시스, Dysbiosis) 상태가 되면, 만성 질환 및 MASH, 제2형 당뇨병, 자가면역질환, 신경퇴행성질환 등의 병리적 기전으로 작용할 수 있습니다. 마이크로바이옴 연구는 질환 치료, 개인 맞춤형 정밀의료로 연계되어 현대의학의 새로운 지평으로 자리잡고 있습니다. 

 


마이크로바이옴 연구 과정에 따른 추천 제품 


Step 1. Step 2. Step 3. Step 4.
샘플 수집 전처리, 균주동정 DNA/RNA 추출  라이브러리 제작 시퀀싱  분석
분석하고자 하는 환경에서 시료를 얻고 전처리 후 동정하는 과정입니다. 시료 내에 존재하는 미생물의 세포벽을 깨고 유전물질을 뽑아내는 과정입니다. 추출한 DNANGS 분석을 하고 정보화 하는 과정입니다. 대조군과 실험군 사이의 차이를 분석하거나 질병과의 관계를 분석하는 과정입니다.
추천
솔루션
미생물 형광 염색 BactoView™ Viability Kits SPINeasy DNA Kit for Microbiome 마이크로바이옴 qPCR Kit Cytokine Multiplex Assay
Viability PCR ribosomal RNA Depletion 시퀀싱 서비스 -- 연구 시약
FDAA 박테리아 형광 이미징    RNA 시퀀싱 서비스  


▒ Genomic DNA 추출 키트

분변 및 장내 미생물을 파쇄하여 Genomic DNA를 추출함으로써 어떤 미생물 군집이 존재하는지 파악할 수 있습니다.

SPINeasy™ DNA Kit 시리즈는 스핀컬럼 테크놀로지를 활용하여 다양한 샘플에서 빠르고 효율적으로 Genomic  DNA를 추출할 수 있습니다.

 

  

 

▒ Microbe RNA-Seq을 위한 rRNA 제거 

 미생물군집에 존재하는 미생물을 동정하기 위해 RNA sequencing이 이용되며, 이때 샘플 내 존재하는 다량의 무의미한 ribosomal RNA를 제거해야 합니다. riboPOOL은 RNA pool로부터 rRNA를 효과적으로 제거하기 위한 툴 입니다.

  

   

 

▒ 박테리아 이미징을 위한 형광 염색

그람염색은 박테리아의 세포벽을 구성하는 펩티도글리칸(peptidoglycan, PG) 두께에 따라 그람양성(보라색)과 그람음성(붉은색)으로 구분할 수 있으나 염색과정이 번거롭습니다. 간편한 박테리아 이미징을 위한 형광 dye와 probe를 소개합니다. 

 

  

 

▒ 살아있는 박테리아 증폭을 위한 Viability PCR

일반적인 qPCR 방법은 살아있는 세포와 죽은 세포를 구별하지 못하지만,  Viability PCR은 살아있는 미생물만 증폭하므로 감도 및 특이성이 높습니다.

 

  

 

▒ 대사산물 분석 키트 

마이크로바이옴은 사람의 장내에서 공생하며, 사람이 먹은 음식으로부터 영양을 얻고 사람에게 필요하거나 해로운 것을 대사산물로 생산하기도 합니다. 아미노산, 탄수화물 등의 대사를 분석할 수 있는 Assay Kit를 제공합니다. 

 

   

 

▒ 항생제

항생제 투약으로 장내 마이크로바이옴을 사멸시킨 동물 질환 모델을 통해 마이크로바이옴의 기능을 역추적할 수 있습니다. 박테리아의 생장을 저해하거나 박테리아를 죽이는 다양한 antibiotics를 제공합니다.

  

 

  

▒ 마이크로바이옴과 질환연구 

장내 미생물은 소화기계, 비만, 자가면역질환, 대사질환, 암, 파킨슨, 치매 등 다양한 질병에 주도적인 역할을 하며, 숙주의 면역 체계 조절에도 관여하고 있음이 밝혀지고 있습니다. 질환 연구를 위한 다양한 툴을 소개합니다. 


 

    

▒ Microbiota-Gut-Brain Axis 

장내 마이크로바이옴과 장 그리고 뇌의 관계에 관한 연구가 늘어가고 있습니다. 장내 미생물에 의해 면역세포 등이 영향을 받으면 cytokine과 장 펩타이드 등이 뇌에 영향을 미칩니다. 그렇게 영향을 받은 뇌는 neurotransmitter나 호르몬 분비 변화를 통해 우울증, 스트레스 반응, 당뇨, 비만 등 다양한 질병 유발에 영향을 미칩니다. 다양한 Hormone 측정 ELISA kit를 제공합니다.

  

  

 

▒ Tumor immune microenvironment (TIME) 

장내 마이크로바이옴과 종양 발현에 관한 연구가 증가하고 있습니다. 마이크로바이옴이 직접적으로 세포에 영향을 주거나, 면역계 조절을 통하여 간접적으로 암의 시작과 진행에 영향을 줍니다. 종양면역미세환경 연구에 관련된 항체 패널을 통해 마이크로바이옴의 변화가 있는 개체에 일어나는 종양 마커를 확인할 수 있습니다. 

  

  

  

▒ Muse Cell Analyzer를 이용한 세포 카운팅

Muse System은 살아있는 세포와 죽은 세포의 투과성 차이로 인한 DNA-염료 결합 차이를 이용하여 손쉽게 Cell Viability를 측정할 수 있습니다. 

 

  

 

▒ 박테리아 항체 

Bacillus, Tetani, Chlamydia, Helicobacter, Salmonella, Streptococcus, Mycoplasma등 다양한 박테리아, 미생물에 대한 항체와 단백질을 제공합니다.   

 

 

  

▒ 박테리아 백신 ELISA 

M. tuberculosis, S. Pneumococcus, Chlamydia pneumoniae, Meningitis 등 Bacteria 항원을 측정하기 위한 ELISA kit 및 백신효과 측정과 백신 접종 후 생성된 immunoglobulin을 측정하기 위한 Vaccine ELISA kit을 제공합니다.

  

  

 

▒ 박테리아 검출 Primer/Probe Kit 

질병을 유발하는 다양한 virus, bacteria, fungi pathogen에 대한 qPCR 및 multiplex qPCR을 수행하기 위한 primer/probe kit을 제공합니다. 

  

 

  

▒ 박테리아 LPS 측정 키트

Lipoglycan이라고도 알려져 있는 Lipopolysaccharides (LPS)는 지질과 폴리사카라이드로 구성된 큰 분자입니다. 그람음성 박테리아의 외막에서 발견되며 내독소로 작용하며 동물에서 강력한 면역반응을 유발합니다. 박테리아 세포에서 LPS를 신속히 추출할 수 있는 Kit를 소개합니다. 

 

  

 

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