SPINeasy DNA Kit for Soil & Feces | 고마바이오텍

특징

• 폐수, 분변, 근권 토양, 석고보드, 진흙, 침전물 등을 포함한 다양한 환경샘플로 부터 DNA 추출이 가능합니다.
• 전세계에서 유일하게 3종류 Beads를 혼합하여, 최적의 파쇄효율을 제공합니다. 
• 특화된 버퍼시스템으로 inhibitor 효율적 제거가 가능합니다.
• 고성능 spin column을 이용하여 높은 Binding Capacity를 제공합니다.
• 추출된 genomic DNA는 PCR, 제한효소 반응, 시퀸싱 등의 downstream analysis에 바로 사용 가능합니다.
  

종류 

사용 방법

1. Lysing Matrix E tube에 토양 샘플 100-500mg 추가합니다.
2. 샘플에 Lysing buffer S1 990 uL, Lysis buffer S2 120 uL, RNase A solution 10uL를 추가하고 잘 섞이도록 vortex합니다.
3. 6.0m/s로 속도를 설정하여 20초 동안 FastPrep Instrument에서 균질화합니다.
4.  5분 동안 14,000 x g로 원심분리를 합니다.
5. 조심스럽게 상층액을 (직접 준비한) 깨끗한 2.0mL microcentrifuge tube에 옮깁니다.
   
6. 이동한 상층액에 250uL의 Inhibitor Removal S을 추가하고 10 번 흔들어 섞어줍니다.
7. 10분 동안 14,000xg 속도로 원심분리합니다.
8. 900uL의 상층액을 (직접 준비한) 깨끗한 2.0mL microcentrifuge tube에 옮깁니다.
9. 이동한 상층액에  900uL의 Binding Buffer S를 추가합니다.
10. 2.0mL Collection Tube 위에 자리한 Column S1에 혼합물 800uL를 옮깁니다.
11. 1분 동안 14,000 x g로 원심분리합니다. Collection tube를 비우고, 재사용합니다. 이 과정을 한 번 반복하고 잔여 혼합물을 폐기합니다.
12. 칼럼에 Wash Buffer S 500uL를 추가합니다. 14,000xg로 1분 동안 원심분리합니다. Collection tube를 비우고 재사용합니다. 워싱 과정을 반복합니다.
13. 액체를 추가하지 않고, 2분동안14,000xg로 원심분리하여 칼럼을 건조시킵니다.
14. Collection tube를 폐기하고 제공된 1.5mL Collection Tube에 칼럼을 자리합니다. 
15. 상온에서 5분 동안 칼럼을 공기 건조시킵니다.
16. 기다리는 동안 water bath를 이용하여 DES Buffer를55도로 가열합니다.
17. 예열한 DES Buffer 100yL를 칼럼 중앙에 추가합니다.
18. DNA를 녹여 분리하기 위해 1분 동안 14,000xg로 원심분리합니다.
19. 녹여 분리된 DNA는 후속 실험을 위해 준비되었습니다. 장기 보관은 영하 20도에서 또는 사용될 때까지 4도에서 보관합니다.

데이터

 Purity 260/280: The genomic DNA extracted with SPINeasy DNA kit for Soil (in blue bar) was the only DNA kit among the comparator DNA kits to show high purity of DNA as assessed by its A260/280 ratio across all the soil sample types studied, which were about 1.80.

    Purity 260/230: The genomic DNA extracted with SPINeasy DNA kit was generally free from the contaminants as assessed by its A260/280which were above 1.0 across all the soil sample types studied. 

 SPINeasy DNA kit for Soil consistently achieved better yield and integrity of extracted DNA across the soil sample types as compared to competitor DNA kits. Total yield is obtained by multiplying the DNA concentration by the final total purified sample volume without visible shearing or smearing during gel electrophoresis.

   M: DNA Marker

  1-5: Organic soil, paddy soil, flowerbed soil, saline soil, desert soil. SPINeasy DNA Kit for Soil from MP Biomedicals 

  6-10：Organic soil, paddy soil, flowerbed soil, saline soil, desert soil. Competitor Kit 1 

  11-15: Organic soil, paddy soil, flowerbed soil, saline soil, desert soil. Competitor Kit 2.