rRNA 제거를 위한 riboPOOL 제작서비스 | 고마바이오텍

특징  

• 시중에 판매되는 rRNA 제거 키트가 없는 특이한 생물이나 복합 샘플을 연구하실 경우, 원하시는 유전자 서열만 보내주시면 3-4주 안에 완벽하게 맞춤형으로 제작해 드립니다. 
• 한 번 데이터가 구축(Established)되고 나면, 다음부터는 추가 비용 없이 일반 기성품처럼 똑같이 저렴하게 재주문할 수 있습니다.

1. 맞춤형 키트(Custom riboPOOL)가 필요한 이유

세포 안에는 리보솜 RNA(rRNA)가 너무 많아서(전체 RNA의 80~90%), 정작 연구하고 싶은 중요한 유전자(mRNA 등)가 가려져 잘 보이지 않습니다. 기성품이 없는 특이한 생물 종이나 샘플이라도, 연구자가 원하는 맞춤형 프로브(DNA 탐침 복합체)를 설계해 rRNA만 선택적으로 결합해 제거(Depletion)해 줍니다.

기존 Workflow에 그대로 적용 가능하며, 일반 시퀀싱(Short/Long-read)은 물론 리보솜 프로파일링(Ribo-Seq)까지 모두 지원합니다.

2. 주요 활용 분야 및 스펙 

• 어떤 샘플이든 가능: 단일 종은 물론 복합 샘플(예: 마이크로바이옴, 해수 샘플 등)도 가능
• 낮은 품질도 가능: 고품질 RNA부터 상태가 좋지 않은 분해된 RNA(예: 암 조직 등에서 얻는 FFPE 샘플)까지 대응
• 용량 맞춤형 제공: 총 RNA 입력 용량에 따라 두 가지 옵션 제공 (10 ng ~ 3 µg 또는 5 µg ~ 30 µg)

3. 맞춤형 rRNA depletion kit 주문 방법

실험 종류에 따라 주문 및 검증 절차가 조금 다르게 진행됩니다.

1) Ribo-Seq (리보솜 프로파일링) 목적일 때

1. 상담 및 데이터 전송: 연구 대상의 RNA 서열(Sequence)을 보냅니다.
2. 1차 설계: 업체가 세포질 내 rRNA를 전반적으로 커버하는 프로브를 설계합니다.
3. 사전 테스트: 먼저 12회 분량(12 reactions)의 예비 키트를 받아 테스트합니다.
4. 최적화 (선택): 테스트 후 rRNA가 덜 제거되었다면, 데이터를 보내 프로브 조성을 수정합니다.
5. 최종 주문: 최적화가 완료되면 최종 키트를 주문합니다. 

2) RNA-Seq (일반 RNA 시퀀싱) 목적일 때

1. 상담 및 데이터 전송: NCBI(국립생물정보센터)에 유전자 정보가 없다면 직접 서열 정보를 보냅니다. (Excel 시트에 적어서 이메일 접수 가능)
2. 수량 선택: 필요한 반응 수(12, 24, 96회 분량 중 택1)를 정해 주문합니다.
3. 제작 및 수령: 맞춤형 키트를 제작하여 3~4주 안에 배송합니다.