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rRNA 제거를 위한 riboPOOL 제작서비스 이미지

rRNA 제거를 위한 riboPOOL 제작서비스

riboPOOL은 다양한 species의 ribosomal RNA와 abundant RNA를 효과적으로 제거하기 위한 DNA probe pool로, RNA-seq의 효율을 높여줍니다. 원하시는 species에 대한 riboPOOL을 제작해 드립니다.

특징 

 

  • ribosomal RNA를 제거하기 위한 oliginucleotide pooling mixture를 제작해 드립니다. 
  • Cytoplasmic, mitochondrial 리보좀 RNA를 효과적으로 제거하며 95%이상의 rRNA depletion efficiency를 갖습니다.
  • Biotin이 coupling되어 있어, Streptavidin-coated magnetic bead를 이용한 target rRNA의 capture, removal이 수월합니다. 
  • Ribo-Zero (Illumina)에 비해 rRNA 제거효율이 높습니다.
  • human/mouse/rat 및 bacteria, archaea, plant, fungi 등 다양한 species에 대한 riboPOOL probe를 제작해 드립니다.
  • Probe만 주문하시거나, Probe와 depletion에 필요한 시약이 모두 제공되는 타입으로 주문하실 수 있습니다. 
  • 원하는 species가 없을 경우 custom으로 제작해 드립니다. 

 

 

종류   

 

       
 

 

riboPOOL rRNA depletion 3 단계


 

  

실험 데이터 

  


 

 


 

 

Data with Pan-Plant riboPOOL – Efficient Across Phyla

 

 

 

Data kindly provided by Dr. Bruno Huettel and Dr. Christian Wöhle, Max Planck Genome Centre Cologne. RNA (1 μg, RIN ~8) was isolated with QIAgen RNeasy and subject to rRNA depletion with Pan-Plant riboPOOL, followed by clean-up with RNA XPClean (Beckman Coulter). Library preparation and sequencing was performed with NEB kit (modified) and Illumina HiSeq3000 respectively. 

   

 

사용 논문 

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Note: This service is for Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 

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    [SITOOL] riboPOOL™ for efficient and flexible ribosomal RNA depletion

    ribosomal RNA를 제거하기 위한 효과적인 툴인 riboPOOL에 대한 웨비나 영상입니다.

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