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rRNA 제거 시약 | Single-Species riboPOOLs 이미지

rRNA 제거 시약 | Single-Species riboPOOLs

특정한 단일 species의 rRNA를 제거하기 위한 riboPOOL을 제작해 드립니다.

특징 

 

  • 특정한 단일 species에서의 ribosomal RNA (rRNA)를 효율적으로 제거합니다.
  • Target gene에 specific한 riboPOOL을 제작합니다.
  • 해당 종의 rRNA의 유형과 특성을 고려하여 riboPOOL probe와 ribosome RNA 시퀀스 간의 가장 높은 특이성을 보장합니다.
  • 알려져 있는 생물체 (예, Escherichia coli, Arabidopsis thaliana, Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans)부터 덜 알려진 종에 이르기까지 약 60여개 종에 대한 riboPOOL 제작이 가능하며, RNA-Seq 및 Ribo-Seq 옵션을 선택하실 수 있습니다. 
  • riboPOOL은 종 전체에 걸쳐 높은 rRNA 고갈 효능을 보이며, 최대 99%에 이릅니다.


Single-Species riboPOOL 디자인 과정



1단계 : 
알고리즘으로 rRNA 시퀀스를 스캔하여 최상의 프로브를 선택합니다. 
최대 및 최적의 rRNA 커버리지, rRNA 시퀀스에 대한 최적의 결합, 유사한 유전자의 타겟팅을 피하여 디자인됩니다. 

 

2단계 : 
riboPOOL은 엄격한 품질 관리 표준에 따라 제조됩니다. 
HPLC를 사용하여 riboPOOL을 정제하여 최고 순도 수준을 보장합니다.

3단계 : 
Target species에 대한 안정적인 ribo-depletion solution을 제공합니다. 
riboPOOL은 모든 종에서 높은 rRNA 고갈 효능을 보이며, 효율은 최대 99%에 이릅니다.





Single-species riboPOOLs 종류 

Species ID Species ID Species ID
A. thaliana degraded RNA 123 Drosophila melanogaster 7 Oryza sativa 9
Acetabularia ryukyuensi 120 E. coli degraded RNA 122 P. pacificus deg. RNA 127
Aedes albopictus 47 E. siliculosus degraded RNA 130 Pichia pastoris (fungi) 19
Amphimedon queenslandica 11 Emiliania huxleyi 33 Pinus sylvestris 108
Anaeramoeba flamelloides 95 Equus caballus degraded RNA 92 Plautia stali 20
Anopheles gambiae 97 Escherichia coli 4 Pseudomonas aeruginosa 18
Apis mellifera 73 Escherichia coli tRNA 334 S. aureus degraded RNA 132
Arabidopsis thaliana  8 Eubacterium limosum 70 S. cerevisiae degraded RNA 125
Argiope bruennichi 74 Felis catus degraded RNA 93 S. pombe 59
Azolla filiculoides 79 Gallus gallus domesticus 60 Saccharomyces cerevisiae 5
Bacillus subtilis 12 H/M/R degraded RNA 56 Salmonella enterica 22
Bemisia tabaci 80 Haloferax volcanii 16 Schistosoma mansoni 90
C. elegans deg. RNA 62 Human 54 Schmidtea mediterranea 28
Caenorhabditis elegans 39 Human Blood 94 Spodoptera exigua 85
Caulobacter crescentus 13 Human Cytoplasm 98 Staphylococccus aureus 21
Chinchilla lanigera 14 Human degraded RNA 57 Stenotro-phomonas sp. 23
Chlamydomonas reinhardtii 71 Human Globin mRNA 25 Strongyloides ratti 106
Clostridium perfringens 15 Human tRNA 317 Thalassiosira pseudonana 96
Crassostrea gigas 63 Ixodes scapularis 30 Toxoplasma gondii deg. RNA 129
Cryptococcus neoformans 84 L. mexicana degraded RNA 126 Trypanosoma brucei deg. RNA 128
Cupriavidus necator 102 Leptinotarsa decemlineata 72 Ustilago maydis 24
D. melanogaster degraded RNA 61 Mouse tRNA 322 Varroa destructor 81
Danio rerio 10 Mouse-Rat degraded RNA 58 Wolbachia pipientis 86
Danio rerio degraded RNA 121 Nematostella vectensis 87
Deroceras laeve  133 Olavius algarvensis 103



주문 방법

1.  위 테이블에서 원하시는 타겟 species와 ID를 알려주세요.
2.  Probe만 필요하신지, 혹은 Probe와 depletion buffer가 함께 제공되는 Kit로 필요하신지 알려주세요. 
3.  상기 목록에 없는 species는 별도로 문의해 주세요.

주문정보

주문정보 - Cat No, PRODUCT, SIZE, 수량 등 항목으로 구성되어있습니다.
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