Antisense RNA Pool 제작서비스 | raPOOL™

제품 상세

Antisense RNA Pool 제작서비스 | raPOOL™

raPOOL™은 RNA Capture를 위한 RNA antisense pool로, 타겟 RNA를 효과적으로 pull down함으로써 RNA-protein complex의 분리에 사용됩니다.

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특징

raPOOL은 Biotinylated antisense DNA oligonucleotide 30개가 pooling된 mixture로, RNA-Protein complex를 pull-down 시키는 툴 입니다.
non-coding RNA와 상호작용하는 단백질, DNA, RNA (interactome)등을 분석하는데 필수적입니다. (예, lncRNA, piRNA)
타겟 RNA에 대해 specific하며 회수율이 100배 이상 높습니다.
RNA enrichment에 재현성과 일관성이 있습니다.

적용

RNA-protein complex의 분리, RNA와 RNA binding protein의 상호작용 연구
non-coding RNA 와 상호작용하는 interactome의 분석 (lncRNA와 상호작용하는 interactome을 co-isolation하여 interactome 내의 단백질, DNA, RNA를 각각 분리, 분석)

원리

단백질/DNA/RNA complex를 lysis 후, raPOOL probe를 처리하여 pull down 시킴으로써, 타겟 RNA-Protein complex를 분리할 수 있습니다.

구성

HPLC purified 3'-biotinylated ssDNA (raPOOLs)
Positive control raPOOLs (positive control: MALAT1)

데이터

Lysates from HeLa cells were incubated with two different raPOOLs against human MALAT1, human XIST or E. coli LacZ (Negative control) for 4 h at 37°C. Following RNA isolation and cDNA synthesis, levels of Cyclophilin A (PPIA), GAPDH or targeted lncRNA, MALAT1, were measured by real-time quantitative PCR. Approximately 100-fold RNA enrichment of the target (MALAT1) was detected that was reproduced by both raPOOLs. Enrichment was specific to the targeted RNA.

Note: This service is for Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

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