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제품 상세

Antibody

6.5 - 270 kDa 범위를 커버하는 3가지 컬러 밴드를 포함하며,
최대 100%까지의 transfer 효과를 개런티하는 Prestained protein ladder를 소개합니다.

CUTANA™ CUT&RUN Library Prep Kit은? 

  

  • Illumina NGS 시퀀싱을 위한 DNA library 준비에 필요한 모든 제품이 포함되어 있습니다. (enzymes, indexing primers, DNA purification beads, buffers, PCR tubes)
  • 특히 CUT&RUN을 이용한 크로마틴 매핑시, CUT&RUN kit와 함께 사용함으로써 cells-to-sequencing solution을 위한 간소화된 프로토콜을 제공합니다. 
  • 0.5 ng 정도의 낮은 input으로도 고품질의 데이터를 제공합니다.

 

 

구성품

  

  • 8-strip tubes (10-0009k)
  • SPRIselect reagent (21-1403)
  • 0.1X TE Buffer (21-1011)
  • End Prep Enzyme (15-1019)
  • End Prep Buffer (21-1012)
  • Adapter for Illumina (18-1000)
  • Ligation Mix (15-1020)
  • Ligation Enhancer (15-1021)
  • U-Excision Enzyme (15-1023)
  • High Fidelity 2X PCR  Master Mix (For sample indexing PCR) (15-1022)
  • i5 and i7 Primers (14-1001 contains i7 primers 1-6 and 14-1002 contains i7 primers 7-12. Both kits contain i5 primers 1-8.)  (Primer  자세히 보기)



Work Flow

 

cut&run library prep kit workflow


 

실험 과정 


cut&run library prep protocol



실험 결과 

  

CUT&RUN DNA 조각 크기 분포 분석

그림 1. 0.5ng 의 적은 인풋으로도 고품질의 시퀀싱 라이브러리 제작. ​Intergrative 500k K562 세포를 이용하여 H3K27me3 항체의 CUT&RUN을 수행한 137kb window를 Genomics Viewer(IGV, Broad Institute)을 이용하여 Gene browser를 촬영하였습니다. 라이브러리 준비 프로토콜에서 CUT&RUN DNA 인풋을 줄여 낮은 타겟 풍부도나 낮은 세포 인풋 실험을 시뮬레이션 했습니다. 데이터는 인풋에 따른 차이를 보이지 않고, Illumina NGS-ready 라이브러리 준비를 풍부하게 보였습니다.

 

 


Representative gene browser tracks

그림 2. CUT&RUN DNA 조각 크기 분포 분석 ​500k K572세포로부터 CUTANA ChIC/CUT&RUN Kit(EpiCypher 14-1048)을 이용하여 CUT&RUN을 수행하였습니다. IgG(EpiCypher 13-0042), H3K4me3(EpiCypher 13-0041), H3K27me3(ABclonal A16199), CTCF(EpiCypher 13-2014) 항체를 이용한 반응에서 얻은 5 ng의 CUT&RUN output DNA로 CUTANA CUT&RUN Library Prep Kitfh paired-end Illumina sequencing을 위해 라이브러리를 준비했습니다. Agilent TapeStation®로 라이브러리 DNA를 분석하였습니다. 




Quality control analysis of the CUTANA™ CUT&RUN Library Prep Kit workflow.

그림 3. Representative gene browser tracks 

 


0.5ng 의 적은 인풋으로도 고품질의 시퀀싱 라이브러리 제작
 

 그림 4. Quality control analysis of the CUTANA™ CUT&RUN Library Prep Kit workflow.

 

 

 

 

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