CUTANA™ DNA Purification Kit | 고마바이오텍

특징

• CUTANA DNA Purification Kit은 CUT&RUN 실험 과정시 genomic fragment (chromatin DNA)의 고수율 정제와 농축을 위해 이용되는 DNA 정제 킷트 입니다.
• low elution volume을 위해 특별히 고안된 tapered cleanup 컬럼을 이용합니다. 
• 이 컬럼은 50bp 이상의 DNA 조각을 회수하여, histone PTM 및 전사인자를 포함한 다양한 CUT&RUN 표적에 이상적입니다. 
• 단 30분안에 정제된 DNA를 얻을 수 있습니다. 
• 정제된 DNA는 바로 CUT&RUN library 준비 및 NGS에 이용될 수 있습니다.

Kit 구성  

• DNA Cleanup Columns (10-0010) 
• DNA Collection Tubes (10-0011) 
• DNA Binding Buffer (21-1008) 
• DNA Wash Buffer (21-1009) 
  
• DNA Elution Buffer (21-1010) 

실험 과정

1. CUT&RUN DNA와 DNA Binding buffer를 혼합하고 실온에서 16,000x g로 30초간 원심분리 합니다.

2. CUT&RUN DNA가 binding된 Column을 DNA Wash buffer로 처리하고 실온에서 16,000x g로 30초간 원심분리합니다. (2번 반복)

3. Column을 16,000x g로 30초간 원심분리하여 건조시킵니다.

4. Column을 1.5ml tube에 넣고 DNA Elution buffer를 처리한 뒤 5분간 방치합니다.

5. 16,000x g로 1분간 원심분리합니다.  

6. Column을 버리고, 정제된 CUT&RUN DNA를 회수합니다. 

Validation Data

Figure 1: CUT&RUN DNA fragment size distribution analysis

500,000 K562 cells per sample were processed with the CUTANA™ ChIC/CUT&RUN Kit (EpiCypher 14-1048) following treatment with IgG negative control (EpiCypher 13-0042), H3K4me3 (EpiCypher 13-0041), H3K27me3 (EpiCypher 13-0030) and CTCF (EpiCypher 13-2014) antibodies. Isolated DNA was used to prepare paired-end Illumina® sequencing libraries, which were analyzed by Agilent TapeStation® , confirming enrichment of mononucleosomes (~300 bp peak represents ~170 bp excised DNA + sequencing adapters).