rRNA 제거 시약 | Ribo-Seq riboPOOLs

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rRNA 제거 시약 | Ribo-Seq riboPOOLs

Ribo-Seq riboPOOL은 ribosome profiling (Ribo-Seq) 샘플에서 rRNA를 제거하기 위한 riboPOOL 입니다.

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특징

리보솜 프로파일링(또는 Ribo-Seq)은 ribosome-protected fragments (RPF)의 분리 및 시퀀싱을 제공하는 차세대 시퀀싱(NGS) 방법입니다. 약 30개의 뉴클레오티드 길이의 이 단편은 리보솜 내에서 발견되는 메신저 RNA(mRNA) section에 해당하며, 일정 기간동안 리보솜에 의해 보호됩니다.
RPF를 시퀀싱함으로써 연구자는 진행 중인 translation의 스냅샷을 캡처하여 단백질 합성에 대한 정량적 개요를 얻을 수 있습니다.
Ribosome Profiling용 riboPOOL은 Ribo-Seq 샘플에서 rRNA를 제거하고 RPF 판독 매핑 속도를 크게 증가 시키도록 특별히 설계되었습니다.

Ribo-Seq riboPOOLs Performance

Ribo-Seq riboPOOL은 리보솜 프로파일링 RNA 샘플에서 rRNA를 효율적으로 제거합니다. Human Ribo-Seq riboPOOL로 ribo-depletion한 후, RPF 판독 매핑 속도가 300% 이상 증가하는 것으로 나타났습니다.

Depletion of transfer RNA (tRNAs)

Transfer RNA(tRNA)도 Ribo-Seq 샘플의 상당 부분을 구성할 수 있으며, 종종 ribo-depletion 후 가장 풍부한 RNA입니다. 따라서 rRNA와 함께 tRNA를 제거하는 것이 종종 효과적입니다. 인간 tRNA 및 마우스 tRNA riboPOOL은 Ribo-Seq 샘플에서 tRNA를 제거하고 Ribo-Seq 샘플에서 RPF를 더욱 풍부하게 하기 위해 개발되었습니다. tRNA riboPOOL은 모든 Ribo-Seq riboPOOL과 직접 혼합하여 rRNA와 tRNA를 동시에 빠르게 고갈시킬 수 있습니다.

Ribo-Seq riboPOOLs 종류

Species	ID	Species	ID
A. castellanii Ribo-Seq	99	Human tRNA Ribo-Seq	325
A. thaliana Ribo-Seq	105	L. mexicana Ribo-Seq	78
Caenorhabditis elegans Ribo-Seq	67	Mouse tRNA Ribo-Seq	326
D. melanogaster Ribo-Seq	76	Mouse-Rat Ribo-Seq	52
Danio rerio Ribo-Seq	101	P. pacificus Ribo-Seq	82
E. siliculosus Ribo-Seq	100	S. aureus Ribo-Seq	131
Escherichia coli Ribo-Seq	104	S. cerevisiae Ribo-Seq	49
H/M/R Ribo-Seq	50	Toxoplasma gondii Ribo-Seq	83
Human Ribo-Seq	42	Trypanosoma brucei Ribo-Seq	77
Human rRNA-tRNA Ribo-Seq	113

주문 방법

1. 위 테이블에서 원하시는 타겟 species와 ID를 알려주세요.

2. Probe만 필요하신지, 혹은 Probe와 depletion buffer가 함께 제공되는 Kit로 필요하신지 알려주세요.

3. 상기 목록에 없는 species는 별도로 문의해 주세요.

주문정보

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