프로테오믹스 분석서비스 | Proteomics Assay Service | 고마바이오텍

In-Solution Protein Identification  

• Recombinant protein expression, affinity purification system 모니터링 등의 용도로 이용됩니다. 
  
• 과정 : Trypsin digestion --> Nano-flow LC-MS/MS using a Q Exactive HF-X Orbitrap mass spectrometer
  
• 리포 : Excel or PDF format, RAW files (요청시)
• 데이터 분석 및 검증 : SEQUEST or Mascot
• 시료량 : (Protein sample in liquid solution or gel band/spot) 100 µg (2 µg/µL 이상)
  
• 최소 볼륨 : 10 µL

Proteome Profiling 

• 수백에서 수천개의 단백질을 동시에 모니터링 합니다. 
• UHPLC-UV sample fractionation은 복잡한 시료 유형에 대해 단백질 서열 범위 및 검출 동적 범위를 극대화 합니다. 
• 시퀀싱 등급 trypsin 또는 대체 단백질 분해 방법을 사용하여 샘플을 digestion 합니다.
• Trypsin으로 분해된 펩타이드 샘플은 nano-flow LC-MS/MS를 사용하여 분석됩니다. 
• Spectral counting 방법은 대략적인 단백질의 relative abundance를 제공합니다. 
• 과정 : (1) Sample preparation  (2) LC-UV fractionation  (3) LC-MS/MS Analysis  (4) Data Analysis and Bioinformatics

Phospho Enrichment Profiling  

• 인산화된 펩타이드는 Fe-NTA를 사용하여 농축됩니다.
• 검출된 단백질 ID, 펩타이드에 대한 PTM 할당 및 PSM 수를 자세히 설명하는 전체 데이터 보고서를 제공합니다.
• 과정 : (1) Sample preparation  (2) Phospho Enrichment  (3) LC-UV Fractionation  (4) LC-MS/MS Analysis  (5) Data Analysis and Bioinformatics

Quantitative Proteomics

• Label-Free DIA : 광범위한 프로테옴 커버리지와 일관된 정량화를 제공합니다. 대량의 코흐트 연구에 적합합니다.
• Isobaric Label TMT : 라벨을 붙인 샘플을 nano-flow LC-MS/MS로 분석합니다. 표지된 펩타이드는 단일 크로마토그래피 피크로 용출되고, 이온화된 펩타이드는 data-dependant selection 및 high-field Orbitrap MS/MS를 사용하여 분석됩니다. 다중화된 표지된 펩타이드는 다중화된 채널 각각에 해당하는 특정 리포터 이온을 생성합니다. 
• Targeted PRM : Parallel Reaction Monitoring (PRM) 기술은 타겟 단백질에 대한 high throughput validation을 제공합니다. 

NOTE : This service is for Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.