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제품 상세
SNAP-ChIP/SNAP-CUTANA Spike-in control 이미지

SNAP-ChIP/SNAP-CUTANA Spike-in control

EPICYPHER의 SNAP-ChIP과 SNAP-CUTANA는 특정 서열에 histone PTM을 포함하는 dNucs (modified nucleosome) 패널을 ChIP 및 CUT&RUN, CUT&Tag 실험에 이용함으로써, 항체의 특이성이나 효율성을 정확히 판독하도록 도와줍니다.

특징 

 

  • SNAP-ChIP Spike-In Panels은 "Sample Normalization and Antibody Profiling for Chromatin Immunoprecipitation"에 사용되는 spike-in  control로, modified nucleosome으로 구성된 패널입니다. 기존 크로마틴 면역침강 실험의 단점을 극복하여, 히스톤 PTM에 대한 항체의 특이성을 높이고 ChIP 데이터를 정규화 (normalization) 하여 보다 정확한 결과를 도모하고 technical variation을 극복합니다.
  • SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel은  CUT&RUN, CUT&Tag 실험시 spike-in으로 사용되는 modified nucleosome으로, 히스톤 PTM(번역 후 변형)에 대한 항체 특이성을 결정합니다. 
  • Modified DNA 시퀀스가 알려져 있는 spike-in control DNA를 이용하여 정규화(normalization) 함으로써 데이터 신뢰도를 향상시킵니다. 
  • NGS를 진행하기 전에 STOP / GO를 결정할 수 있는 자료를 제공합니다. 

  

 

원리 

특정 DNA 시퀀스(barcode)로 식별되는 PTM을 가진 재조합 dNucs pool은 IP전에 sample chromatin에 첨가되고, barcoded nucleosome을 capture함으로써 항체 특이성을 모니터링  할수 있습니다. 


 

  

과정



종류 


1. SNAP-ChIP Spike-In Panels

 

  • 3'말단의 특이한 DNA 시퀀스("barcode")에 의해 식별되는 서로 다른 nucleosome 15가지와 1가지 unmodified nucleosome의 mixture pool입니다.
  • 모든 ChIP work flow에 이용할 수 있습니다.
  • Panel의 Modification site는 모두 lysine methylation에 의해 결정되기 때문에, 유연성을 극대화하고 상세한 항체 교차 반응 데이터 확인이 가능합니다.
  • 낮은 lot-to-lot variation 을 제공합니다. (높은 재현성) 
  • Enzyme screening assays 및 Effector protein binding experiments 실험에서 ChIP spike-in 대조군으로 이용될 수 있습니다.

  SNAP-ChIP Spike-in Panels
  K-MetStat Panel  OncoStat Panel K-AcylStat Panel
  Cat. No. 19-1001 10 ChIP reactions
19-1100 100 ChIP reactions
19-2001 10 ChIP reactions
19-2100 100 ChIP reactions
19-3001 10 ChIP reactions
19-3100 100 ChIP reactions
  구성 16 nucleosomes pool
(1 unmodified plus 15 histone H3 or H4 PTM)
8 nucleosomes pool
(1 unmodified (H3.3) plus 7 histone H3.3 point mutations)
23 nucleosomes pool
(1 unmodified plus 22 histone H2A, H3, or H4)
  Histone H3K4me1, H3K4me2, H3K4me3, H3K9me1, H3K9me2, H3K9me3, H3K27me1, H3K27me2, H3K27me3, H3K36me1, H3K36me2, H3K36me3, H4K20me1, H4K20me2, H4K20me3, me0 (unmodified). H3.3, H3.3K4M, H3.3K9M, H3.3K27M, H3.3G34R, H3.3G34V, H3.3G34W,  H3.3K36M. H3K4ac, H3K9ac, H3K14ac, H3K18ac, H3K23ac, H3K27ac, H3K36ac, H4K5ac, H4K8ac, H4K12ac, H4K16ac, H4K20ac, H3K9bu, H3K9cr, H3K18bu, H3K18cr, H3K27bu, H3K27cr, H3K27acS28phos, H3K4,9,14,18ac, H4K5,8,12,16ac and unmodified.




2. SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel (#19-1002) 

  • CUT&RUN 및 CUT&Tag용 spike-in control입니다.
  • Histone PTM에 대한 항체 특이성을 결정하고 분석 성공을 모니터링하고, 정량 염색질 매핑을 위한 데이터를 정규화하는 올인원 솔루션을 제공합니다. 
  • 패널에는 H3K4, H3K9, H3K27, H3K36 및 H4K20에 mono, di, trimethylation이 반영된 dNuc과 unmodified control, 총 16가지 K-methyl PTM 상태를 나타내는 뉴클레오솜(dNuc)이 포함되어 있습니다.
  • 패널은 Histone lysine methylation 또는 IgG 음성 대조군을 표적으로 하는 항체를 추가하기 전에 ConA 고정 세포와 함께 샘플에 추가됩니다. 




주문정보

주문정보 - Cat No, PRODUCT, SIZE, 수량 등 항목으로 구성되어있습니다.
  Product Cat.No. Size Maker Qty Data Sheet MSDS
SNAP-ChIP® K-AcylStat Panel 19-3001 20 ul EPICYPHER
SNAP-ChIP® K-AcylStat Panel 19-3100 200 ul EPICYPHER
SNAP-ChIP® K-MetStat Panel 19-1001 20 ul EPICYPHER
SNAP-ChIP® K-MetStat Panel 19-1100 200 ul EPICYPHER
SNAP-ChIP® OncoStat Panel 19-2001 20 ul EPICYPHER
SNAP-ChIP® OncoStat Panel 19-2100 200 ul EPICYPHER
SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel 19-1002 50 Reactions EPICYPHER
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-3001
Product
SNAP-ChIP® K-AcylStat Panel
Size
20 ul
Qty
Data Sheet
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-3100
Product
SNAP-ChIP® K-AcylStat Panel
Size
200 ul
Qty
Data Sheet
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-1001
Product
SNAP-ChIP® K-MetStat Panel
Size
20 ul
Qty
Data Sheet
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-1100
Product
SNAP-ChIP® K-MetStat Panel
Size
200 ul
Qty
Data Sheet
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-2001
Product
SNAP-ChIP® OncoStat Panel
Size
20 ul
Qty
Data Sheet
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-2100
Product
SNAP-ChIP® OncoStat Panel
Size
200 ul
Qty
Data Sheet
Maker
EPICYPHER
Cat.No.
19-1002
Product
SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel
Size
50 Reactions
Qty
Data Sheet

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0.5 ml Elite Pre-stained Protein Ladder (2 x 0.25 ml) PAL-EPL-500 0.5ml 500
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