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PROTAC 모니터링을 위한 SPRINTer Protein Turnover Biosensor Cell Line 이미지

PROTAC 모니터링을 위한 SPRINTer Protein Turnover Biosensor Cell Line

Eurofins DiscoverX의 SPRINTer™ Endogeneous Protein Turnover Biosensor Cell line은 disease-relevant cell model에 약물(예, PROTAC)을 처리하여 drug-induced protein turnover를 monitoring하기 위해 사용됩니다.

특징

 

  • SPRINTer (Sensing Protein Internal Turnover) Protein Turnover Biosensor Cell line은 PROTAC에 의해 유도되는 target 단백질의 분해를 정량하는데 이용됩니다.
  • Stable한 biosensor로 작용하는 cell line은 CRISPR/Cas9 기술을 이용하여 Enzyme Fragment Complementation (EFG) Enzyme Donor (ED)를 타겟 gene에 융합하여 ED-tagged target 단백질이 발현되도록 엔지니어링 되었습니다.
  • BRD4  혹은 c-Myc을 발현하는 colon cancer (HCT-116) cell과 blood cancer (K562) cell model을 제공합니다.
  • PROTAC에 의해 유도된 단백질의 분해와 합성 (protein turnover)를 모니터링 할 수 있습니다.
  • 타겟단백질의 turnover를 micro/nanomolar 수준으로 민감하게 측정할 수 있습니다.
  • 5시간 이내에 빠른 결과를 얻을 수 있으므로 효과적인 약물을 좀더 신속하게 판별할 수 있습니다.

 


원리

  • Sensor cell line은 ED가 tagging된 타겟 단백질을 발현하고, 여기에 PROTAC을 처리하면 이에 의해 타겟 단백질이 분해되므로 EFC 시그널이 소실됩니다. 즉, PROTAC에 의해 분해된 단백질의 양이 많을 수록 소실된 시그널이 많이 발생하는 원리입니다.




참고 데이터

  • Differentiate PROTAC Efficacies Using Different Cell Lines That Represent Disease-Relevant Cell Models



Select PROTACs display distinct efficacies among different cell types. A. SPRINTer HCT116 ED-BRD4 and B. SPRINTer K-562 ED-BRD4 cell lines were treated with BRD4 PROTACs (MZ1, dBET1, and JQ1-idasanutlin) for 5 hours and evaluated by EFC assay. Differences in rank order (and potency) of BRD4-targeted PROTACs that engage different E3 ligases were observed between the two cell types. JQ1-idasanutlin was shown to be more efficacious in the HCT-116 cell type compared to the K-562 cell type. C. Gene expression analysis reveals differential expression levels of MDM2 (which targets E3 ligase of JQ1-idasanutlin) between HCT116 and K-562 cell lines with lower expression seen in the K-562 cell line. This data suggests the abundance of the target E3 ligase in different cell lines is a key factor that influences the efficacy of JQ1-idasanutlin. Additionally, these results advise that it is important to choose a cell type with relevant expression of the E3 ligase that you are targeting. Note this same difference in potencies in K-562 to HCT116 cell lines also holds true for the equivalent c-myc cell lines (data available upon request). For comparison in the gene expression analysis, VHL and cereblon E3 ligases were also analyzed (noting VHL is the E3 ligase target for MZ1, and Cereblon is the E3 ligase target for dBET1), and POLR2A (RNA polymerase II subunit A) was used as a gene expression control. 



주문정보

주문정보 - Cat No, PRODUCT, SIZE, 수량 등 항목으로 구성되어있습니다.
  Product Cat.No. Size Maker Qty Data Sheet MSDS
SPRINTer HCT-116 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line 91-1004C047 2 vials EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer HCT-116 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line 91-1003C047 2 vials EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer K562 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line 91-1002C042 2 vials EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer K562 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line 91-1001C042 2 vials EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer™ HCT-116 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack 491-1004C047 Pack EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer™ HCT-116 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack 491-1003C047 Pack EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer™ K562 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack 491-1002C042 Pack EUROFINS DISCOVERX
SPRINTer™ K562 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack 491-1001C042 Pack EUROFINS DISCOVERX
Maker
EUROFINS DISCOVERX
Cat.No.
91-1004C047
Product
SPRINTer HCT-116 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line
Size
2 vials
Qty
Data Sheet
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EUROFINS DISCOVERX
Cat.No.
91-1003C047
Product
SPRINTer HCT-116 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line
Size
2 vials
Qty
Data Sheet
Maker
EUROFINS DISCOVERX
Cat.No.
91-1002C042
Product
SPRINTer K562 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line
Size
2 vials
Qty
Data Sheet
Maker
EUROFINS DISCOVERX
Cat.No.
91-1001C042
Product
SPRINTer K562 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line
Size
2 vials
Qty
Data Sheet
Maker
EUROFINS DISCOVERX
Cat.No.
491-1004C047
Product
SPRINTer™ HCT-116 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack
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Pack
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Cat.No.
491-1003C047
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SPRINTer™ HCT-116 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack
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Cat.No.
491-1002C042
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SPRINTer™ K562 BRD4 Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack
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491-1001C042
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SPRINTer™ K562 c-Myc Protein Turnover Biosensor Cell Line Starter Pack
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