1. RNAscope In Situ Hybridization (ISH) 분석서비스는 어떤 특징을 갖고 있나요?
In Situ Hybridization (ISH)는 세포나 조직에서 특정한 유전자의 정확한 위치를 확인하는 방법입니다. 측정하고자 하는 타겟 mRNA에 대한 상보적인 probe를 제작하여 세포/조직에 반응시킴으로서 유전자의 발현 양상, 위치, 패턴등을 시간적, 공간적으로 확인할 수 있습니다.
RNAscope는 ACD사 만의 특별한 Probe 디자인 기술을 이용하여 single RNA 분자 수준까지도 탐지할 수 있는 고품질의 ISH 방법으로, 조직을 보내주시면 ISH 분석 리포트를 보내드립니다.
ISH 분석서비스는 약물처리 전후의 샘플 비교, 정상/질병 조직의 표적 발현 수준 평가, 유전자세포 치료제 개발시 AAV의 생체내 분포 확인을 통한 안전성 평가, CAR/TCR의 생체분포의 시각화와 기능 평가 등 다양한 연구에 이용될 수 있습니다.
2. 분석 과정은 어떻게 되나요?
세포/조직은 probe가 반응할 수 있게 처리되고, 이후 RNA probe를 처리한 후 시그널을 증폭하고 가시화 한 후 전용 소프트웨어를 통해 발현을 분석합니다.
3. 분석서비스는 어떻게 진행되나요?
우선 ACD사의 PhD-level scientist, pathologist, image analysis specialist가 원하시는 연구의 목표를 상담하고 실험을 디자인합니다. 보내주시는 조직과 RNA 품질을 확인하고 실험 최적화과정을 거치고, marker staining과 whole slide scanning을 진행하고, 이미지를 분석한 후 전문가 리포트를 제공합니다.
4. 어떤 종류의 분석 결과를 제공하나요?
Semi-Quantitative Visual Scoring
• 0-4 scoring - % expression
Visual H Scoring
• Binned data
• Quantify heterogeneity in marker expression
Pathologist Notes
• Pathologist annotations
• Cell-type or region of interest scoring
Digital Image Analysis
• Cell-by cell data; dot count vs area count; H-Score
• HALO™ AI, spatial analysis modules
5. ISH와 IHC 분석 결과를 함께 볼 수 있나요?
네, ISH-IHC co-detection을 통해 동일한 슬라이드에서 단백질과 RNA를 동시에 검출할 수 있습니다.
6. 어떤 종류의 control이 이용되나요?
샘플당 최소 3장의 슬라이드를 실행합니다. (target marker panel, a positive control, a negative control) 양성 대조군은 조직 표본의 RNA 품질이 RNA 표적을 검출하기에 충분한지 여부를 결정하는데 중요합니다. 박테리아 dapB 음성 대조군은 조직 표본이 분석을 위해 적절하게 준비되었는지 여부를 결정하는 데 도움이 됩니다.
단일 분석에서는 PPIB를, 이중분석에서는 POLR2A와 PPIB를, 다중분석에서는 POLR2A, PPIB, UBC를 양성대조 probe로 이용합니다.
7 ISH가 어떤 실험에 이용되었는지 분석 사례를 볼 수 있을까요?
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