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RNA In situ hybridization (ISH) 분석서비스 이미지

RNA In situ hybridization (ISH) 분석서비스

ACD사의 in situ hybridization (ISH) assay service는 세포나 tissue에서 표적 RNA의 발현을 분석하는 서비스입니다. ISH 염색 및 이미지 분석을 통해 single RNA molecule을 탐지하고 유전자 발현의 공간적인 해석을 제공합니다.

특징  

 

"Any RNA, in ANY species, in ANY tissue" 

 

  • 보내주시는 조직 샘플에서 발현된 타겟 RNA의 localization을 탐지하고, 이미지 분석 및 전문 병리학자의 리뷰가 반영된 레포트를 제공합니다. 
  • Single, Dual 타겟 뿐 아니라 여러 RNA 타겟을 동시에 확인할 수 있는 Multiplex ISH 서비스도 가능합니다.  
  • 컬러발색 혹은 형광방법을 선택하실 수 있습니다.
  • ISH/IHC를 접목하여 RNA/Protein co-detection을 제공합니다. 
  • ISO13485 인증기관으로, 임상 검체 분석이 가능하며 임상적·생리적·병리적 상태와 관련된 결과를 확인하실 수 있습니다. 
  • 원하시는 분석에 대한 초기 상담부터 결과까지 상세히 지원해 드립니다. 

 



적용

  • 약물처리 샘플과 미처리 샘플, 혹은 질병조직과 정상조직에서의 표적발현 수준을 평가하고 검증합니다.
  • 후보 바이오마커 발현을 평가합니다.
  • 유전적으로 변형된 transgene과 AAV 벡터의 생체 분포를 프로파일링 합니다.
  • Tumor 미세환경에서 CAR/TCR의 생체 분포 확인 및 면역세포 마커와의 공동 검출을 통해 기능을 평가합니다.
  • 전임상 ADME 및 안전성 평가를 위한 tissue screening을 제공합니다.






Probe 특성 및 원리

  • 타겟 RNA에 대한 Z 형태의 probe가 두개 한쌍의 (ZZ) 구조로 구성되며 pool로 제작됩니다.
  • Pre-amplifier 및 형광/컬러로 라벨링된 amplifer를 통해 타겟 RNA가 염색되어 sensitivity가 높습니다.
  • 현미경 관찰 및 전용 소프트웨어를 통해 single RNA molecule을 탐지하고 분석합니다. 
  • ZZ가 모두 타겟에 binding되었을 때에만 데이터로 인정되어 specificity가 높습니다.

ACD-principle
Step 1. 더블 Z (ZZ) 구조의 probe가 RNA 타겟에 hybridization 됨. 
Step 2. Pre-amplifier가 각 ZZ probe에 hybridization 됨.
Step 3. Amplifier는 각 pre-amplifier의 multiple binding site에 binding 됨.
Step 4. 형광물질 혹은 컬러로 labeling된 probe가 amplifer에 binding 됨.



Probe 목록  

  • human, mouse, rat, dog, cow, zebrafish, rabbit, pig, chicken, monkey를 포함한 400개 이상의 종과 100개 이상의 바이러스에 대한 RNAScope 분석 전용 probe를 제공하고 있습니다. 
  • 목록에 없을 경우 custom order로 진행해 드립니다.
  • COVID-19, ZIKA, MERS에 대한 3-4개의 probe로 구성된 probe set를 제공합니다. 




분석 종류 

1.  300 nt 이상의 mRNA, IncRNA 분석 (RNAscope Assay)
2. 50-300 nt의 RNA의 point mutation 분석 (BaseScope Assay)
3. 17-50 nt의 small RNA 확인 (ASOs, miRNA, piRNA, shRNA, siRNA, tRNA) (miRNAscope Assay)



분석 예시

1) Immune checkpoint marker coexpression analysis 
CD45 항체를 이용한 IHC (면역조직화학염색)과 PDL1 ISH를 통해 조직 슬라이드 상에서의 단백질과 RNA의 발현 localization을 함께 확인




2) Neuroscience 
mouse striatum에서 Dopamine Receptor  D1과 D2 발현을 동시에 확인 




3) RNAscope HiPlex assay on human FFPE cervical cancer tissue, using Alexa 488, DL550 and DL650 fluorophores for the detection of HiPlex12 positive control probes RPL5, B2M, and ACTB.
자궁경부암 조직에서 HiPlex assay kit을 이용한 multiplex 형광염색 






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Note: This service is for Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 

주문정보

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