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Oncology 분석서비스 | OncoPanel™ Cell-Based Profiling Service 이미지

Oncology 분석서비스 | OncoPanel™ Cell-Based Profiling Service

Maker : EUROFINS DISCOVERY

EUROFINS DISCOVERY의 OncoPanel™ Cell-Based Profiling Service는 300가지 이상의 암세포주에 대한 항암제의 효과를 보기 위한 cellular & genomic Oncopanel Screening과 Oncopanel Profiling 서비스를 제공합니다.

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특징

 

  • 19개의 서로 다른 조직 유형, 300개 이상의 2D 암세포주와 100개 이상의 3D 종양 spheroid 모델에 대한 항암제 후보 물질 약물 반응 효과를 스크리닝 합니다.  

  • mRNA 과발현, 증폭, 삭제, 코딩 및 비코딩 돌연변이, 기능 돌연변이 획득 또는 손실을 포함하여 250,000개 이상의 유전적 이상에 대한 데이터 기반 통찰력을 얻을 수 있습니다. 

  • 생성된 데이터는 환자의 치료에 대한 반응을 예측하거나 잠재적인 내성 기전에 대한 게놈 특이적 바이오마커 및 유전자형을 식별하여 암세포에 가장 효과적인 약물을 도출할 수 있습니다. 
  • 모든 게놈 분석은 데이터베이스에 있는 19,000개 이상의 유전자와 250,000개 이상의 게놈 특징을 참조하며 200개 이상의 세포주가 포함된 패널의 표준으로 포함됩니다.
  • OncoPanel™ Services Genomics Analysis Sample Report 예시 

 


목적에 따른 다양한 실험 설계 제공

  • Screening: anti proliferative activity를 갖는 화합물을 초기단계에서 스크리닝하여 활성 확인
  • Profiling: 후기 단계의 화합물을 다양한 세포주에서 Genome Biomarker 식별
  • Repurposing of Compounds: 승인된 약물에 대한 항암제로서의 가능성 식별


데이터 옵션

  • Singleplex 
    • Cell proliferation - including IC50, EC50, and GI50, integrated area values and intra-assay doubling time.
  • Multiplex
    • Cell proliferation - including IC50, EC50, and GI50, integrated area values and intra-assay doubling time.
    • Apoptosis - concentration required for significant caspase-3 induction (5-fold and 6SD over vehicle) and maximum fold induction (Emax).
    • Cell cycle - concentration required for significant increase or decrease (2-fold relative to vehicle) in histone H3 phosphorylation.
  • Univariate Genomic Analysis
    • Identify and prioritize predictive genomic biomarkers from drug response data by analysis of hundreds of thousands of genomic features.  Genomic features that are analyzed include mRNA overexpression, amplifications, deletions, coding, and non-coding mutations and gain/loss of function lesion categories.  Analysis in the context of cancer subtypes and tissue classification.


 


Pie chart of 19 different tissue or tumor lineage types represented in OncoPanel.

 

 

 

 


Spheroid models of four different tumor cell lines imaged at 10X magnification under brightfield illumination prior to test agent addition, as part of routine QC processes.

 

 

 

 


A database of genomic features evaluated for correlation to PD0325901 responsiveness, as measured by cell count IC50. Use of orthogonal Student’s t-test (x axis) and Fisher’s exact test (y axis) address mathematical bias, allowing identification of biologically relevant features significant by both. Genomic features satisfying both significance thresholds, and with q-values (FDR) <0.1, are colored dark green and annotated.

 

  

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OncoPanel™ Cell-Based Profiling 스크리닝 서비스 . . EUROFINS DISCOVERY
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