시약 및 기기 상세 CUTANA™ Fiber-seq Kit Maker : EPICYPHER 유전적 정보와 후성유전(epigenetic) 특징을 동시에 읽는 Fiber-seq을 수행하기 위한 assay kit을 제공합니다. 프린트 제품 문의 특징 Fiber-seq은 크로마틴 접근성, DNA 메틸레이션, 유전적 변이를 동시에 프로파일링 합니다. 일반적으로 ATAC-seq, ChIP-seq, Bisulfite sequencing 등의 여러 개별 시험이 필요한 분석을 long-read sequencing (LRS) 기반의 실험 한 번으로 통합 데이터를 얻을 수 있습니다. 세포에서 시작하여 라이브러리 준비가 가능한 DNA까지 얻는데 필요한 핵심 시약을 모두 포함하고 있습니다. User Manual에는 상세한 프로토콜, QC 항목, FAQ, 전문가 팁까지 포함되어 실험을 쉽게 시작할 수 있습니다. (간단한 요약 프로토콜 포함 제공) Fiber-seq은 일반적인 LRS 라이브러리 준비 직전에 2시간 이내로 수행할 수 있으며 주요 LRS 플랫폼의 라이브러리 준비 kit와 호환성이 검증된 시약을 사용합니다. Hia5는 현재 사용 가능한 6mA methyltransferase 중 가장 활성이 높은 효소이며 본 kit에 독점적으로 포함됩니다. 높은 효소 활성으로 더 짧은 반응 시간을 가능하게 하여 protein footprint의 해상도가 향상됩니다. 각 Lot은 일관된 결과를 보장하기 위해 철저한 QC 검사를 통과하여 출시됩니다. Kit를 통해 얻은 정제된 genome DNA는 PacBio® HiFi Sequencing, Oxford Nanopore Technologies®(ONT) Nanopore Sequencing 의 라이브러리 준비 워크플로우에 직접 사용할 수 있습니다.Fiber-seq의 권장 입력량은 반응 당 1,000,000개의 사람 유래 native nuclei입니다. 냉동 보관된 핵이나 약하게 cross-link된 핵에도 성공적으로 적용되었습니다. Fiber-seq은 단일 시험으로 크로마틴 접근성, DNA 메틸레이션, 그리고 뉴클레이좀 위치를 genome-wide에서 동시에 포착합니다. 위 그림은 전사 시작 부위 (TSS)를 중심으로 한 6mA 신호, 뉴클레오좀 위치, 내인성 5mC 수준에 대한 정렬된 단일 분자 데이터를 보여줍니다. 6mA가 풍부한 TSS에서는 잘 정의된 뉴클레오좀 배열과 5mC의 감소가 나타나며 이는 프로모터 영역의 특성과 일치합니다. 이러한 패턴은 히스톤 변형을 위한 CUT&RUN 프로파일과도 유사하며 여기에는 H3K4me3 (활성 TSS 표시)와 H3K27me3 (억제된 유전자 표시)가 포함됩니다. Fiber-seq 워크플로우분리된 핵은 Hia5 N6-methyladenine methyltransferase (6mA MTase)와 보조 인자 S-Adenosylmethionine(SAM)를 함께 반응시켜 접근 가능한 크로마틴 영역 내의 아데닌을 선택적으로 메틸화합니다. 10분 간 라벨링을 진행한 후, 반응을 정지시키고 genome DNA (gDNA)를 정제하여 long-read sequencing에 사용할 수 있도록 준비합니다. Long-read sequencing 데이터는 이후 단일 분자 수준에서 분석되어 샘플 내 크로마틴 구조의 이질성을 파악하거나 크로마틴 접근성 및 DNA 메틸화의 샘플 전반적인 패턴을 식별하는데 활용됩니다. Kit 구성품 Item Cat No gDNA Spin Columns 10-0016-09 gDNA Collection Tubes 10-0017-09 gDNA Cell Lysis Buffer 21-1029-09 gDNA Binding Buffer 21-1030-09 gDNA Wash Buffer 21-1031-09 gDNA Elution Buffer 21-1032-09 Pre-1X Reaction Buffer 21-1033-09 Pre-Nuclei Extraction Buffer 21-1021-09 1 M Spermidine 21-1005-09 Proteinase K 15-1033-09 RNase A 15-1034-09 SAM 21-1034-09 Hia5 for Fiber-seq 15-1032-09 주문정보 견적문의 제품담기 주문정보 - Cat No, PRODUCT, SIZE, 수량 등 항목으로 구성되어있습니다. Product Cat.No. Size Maker Qty Data Sheet MSDS CUTANA™ Fiber-seq Kit - 24 Reactions 14-2001-24rxn 24 Reactions EPICYPHER - + 보기 보기 CUTANA™ Fiber-seq Kit - 8 Reactions 14-2001-8rxn 8 Reactions EPICYPHER - + 보기 보기 1 Maker EPICYPHER Cat.No. 14-2001-24rxn Product CUTANA™ Fiber-seq Kit - 24 Reactions Size 24 Reactions Qty - + Data Sheet 보기 2 Maker EPICYPHER Cat.No. 14-2001-8rxn Product CUTANA™ Fiber-seq Kit - 8 Reactions Size 8 Reactions Qty - + Data Sheet 보기 first 1 last 추천제품 CUTANA™ Hia5 for Fiber-seq enzyme [FAQ] Fiber-seq이란 무엇인가요? Epigenetic 분석 서비스 | Epigenetic Assay Service 에피제네틱스 연구를 위한 EpiCypher 솔루션 에피제네틱스 | Epigenetics Inhibitors & Activators 관련제품 견적문의 제품담기 주문정보 - Cat No, PRODUCT, SIZE, 수량 등 항목으로 구성되어있습니다. Product Cat.No. Size Maker Qty Data Sheet MSDS 자료 웨비나/Video
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