RNAscope® ISHㅣ유전자 치료 연구를 위한 고감도 RNA 발현 분석 | 고마바이오텍

특징 

다양한 연구 분야에 적용 가능한 고감도 RNA 시각화 솔루션 

• 단일 분자 수준에서 RNA 검출 및 발현 패턴 분석, 다양한 세포 및 조직 샘플에 적용 가능
• 신약개발, 바이오마커 검증, 기초 연구 등 다양한 분야에 최적화
• ACD의 전문 분석팀이 맞춤형 분석과 고품질 이미지를 제공

유전자 치료 연구에서의 활용

• AAV 벡터의 조직 분포 및 세포 친화성 분석
• 유전자 발현 및 지속성 평가
• CAR/TCR T세포 치료제의 타겟 유전자 발현을 조직 샘플에서 정밀하게 측정
• 표적 전사체와 세포 마커의 co-detection

자동화된 RNAscope 분석 워크플로우

조직 절편에서 신호를 증폭한 후, 발색(Chromogenic) 또는 형광(Fluorescent) 방식으로 검출합니다.

적용사례

1. AAV 벡터의 조직 분포 (Therapeutic Biodistribution)

 - 조직 내 발현 위치 확인 

 - 세포 친화성 (cellular tropism) 평가

그림 1. ​RNAscope을 통한 세포 내 흡수 및 세포 친화성의 시각화 

(A) 세포 간질(interstitial space)에 주로 존재하는 AAV 벡터
(B) HALO® (Indica Labs) 오버레이 분석을 통해 AAV 양성 핵(red)과 AAV 음성 핵(white)을 구분
(C) 핵 내부에서 검출된 신호와 핵 외부에서 검출된 신호의 비율을 정량화하여 시각적으로 평가

2. 유전자 발현 & 지속성      

 - 전달 유전자 발현 수준 측정 

 - 치료 지속성 분석

그림 2. RNAscope 분석을 통한 생체 분포 관찰

AAV로 처리된 non-human 영장류의 망막 조직을 RNAscope LS Duplex ISH 분석법으로 염색하여, AAV 벡터의 프로모터 서열(green)과 GFP 형질전환 유전자(red) 발현을 동시에 검출한 결과

3. 세포 기반 치료제 타겟 발현

 - CAR/TCR T세포 타겟 발현 확인

 - 조직 샘플 내 정밀 분석

그림 3. CAR 및 TCR T세포 침윤 및 활성화

(왼쪽) RNAscope Duplex ISH/IHC로 염색한 인간 지방육종(FFPE) 임상 시료에서, 변형된 TCR-T 세포(red, RNAscope ISH) 및 CD3(teal, IHC) 발현을 검출한 결과

(오른쪽) TCR T세포 주입 후 관찰된 anti-tumor 효과.

(Ramachandran et al., Adaptimmune, ASCO-SITC 2018.)

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