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제품 상세

Antibody

6.5 - 270 kDa 범위를 커버하는 3가지 컬러 밴드를 포함하며,
최대 100%까지의 transfer 효과를 개런티하는 Prestained protein ladder를 소개합니다.

 

CUT&Tag 분석을 위한 모든 시약이 제공되는 CUTANA™ CUT&TAG Kit가 출시되었습니다! (바로가기) 


CUTANA™ CUT&TAG Assay란?  

 

  • CUT&Tag (Cleavage Under Targets & Tagmentation)는 CUT&RUN(Cleavage Under Targets & Release Using Nuclease) 방법을 기반으로 하는 새로운 면역 테더링 분석법입니다.
  • 샘플이 매우 적은 경우 (5000개 미만의 cell로 histone PTM을 profiling 할때) 효과적입니다.
  • Protein A / Protein G / Tn5 transposase (pAG-Tn5)는 항체가 결합된 염색질의 절단과 시퀀싱 adapter ligation을 유도합니다. 그후 library 준비 과정이나 염색질을 단편화하는 과정이 필요없습니다. 
  • ChIP-seq 대비 비용이 3배이상 절약됩니다.
  • 다양한 종의 항체를 사용할 수 있습니다. 



원리

 

cut&tag원리
 

 

(1) Nuclei 를 bead에 immobilized 시킵니다.
(2) Primary & Secondary antibody와 histone PTM or Chromatin-interacting protein를 반응시킵니다.
(3) pAG-Tn5 로 target-DNA complex를 분리하고 sequencing adapter를 ligation 시킵니다. 
(4) PCR로 DNA를 증폭시키고, 바코드 adapter를 ligation 시킵니다.
(5) NGS로 시퀀싱을 진행합니다.



Workflow

cut&tag workflow



사용 논문

Kaya-Okur et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat. Comm. 10, 1930 (2019). (PMID: 31036827)

This paper introduces CUT&Tag methodology, as developed by the Henikoff laboratory at the Fred Hutchinson Cancer Research Center. It describes how the Tn5 fusion proteins works, demonstrates the application of CUT&Tag for histone PTM and chromatin factor profiling, and reveals major advantages of this new technology. Specifically, they use CUT&Tag to generate high-quality histone PTM profiles from single cells, a major advancement for the epigenetics field.

Kaya-Okur et al. Efficient low-cost chromatin profiling with CUT&Tag. Nat. Protoc. 15, 3264-3283 (2020). (PMID: 32913232)

Here, the inventors of CUT&Tag provide a highly detailed description of their optimized CUT&Tag protocol, citing EpiCypher’s pAG-Tn5 as the suggested commercial vendor of the enzyme. The protocol highlights critical steps, includes a troubleshooting FAQ table, and shows example results.

Henikoff et al. Efficient transcription-coupled chromatin accessibility mapping in situ. by nucleosome-tethered tagmentation. Elife 16;9:e63274.(2020). (PMID: 33191916)

In a paper from the inventors of CUT&RUN / CUT&Tag technology, they leveraged EpiCypher’s pAG-Tn5 and CUT&RUN compatible histone PTM antibodies to develop a modified version of CUT&Tag for chromatin accessibility mapping. Importantly, this new method generates robust, high-quality profiles using only 3-5M reads/samples (vs. 20-30M reads for standard ATAC-seq).



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