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 제품안내  분석 제작 서비스   유전자, 단백질 제작서비스

riboPOOL 제작서비스 & riboPOOL kit

riboPOOL은 Biotinylated single stranded DNA probe mixture로, Ribosomal RNA를 depletion 함으로써, 중요한 의미를 갖는 RNA만 분리할 수 있습니다. 이렇게 rRNA가 제거된 농축된 RNA fraction은 NGS를 통해 Transcriptome profiling에 이용됩니다.

이미 검증된 species에 대해서는 Ready-made riboPOOL로 제공이 되며, 사용의 편리를 위하여 reaction kit로도 제공합니다.

그외의 species에 대해서는 custom service를 통해 제작을 요청하실 수 있습니다.

siTOOL
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  • riboPOOL은 모든 리보좀 RNA (cytoplasmic + mitochondrial)를 고효율로 제거하는 Biotinylated single stranded DNA probe mixture 입니다.
  • Ribosomal RNA (rRNA)는 total RNA의 약 90%를 차지하며 NGS library 제작 전에 제거(depletion)함으로써 유의미한 RNA 분석을 가능하게 합니다.
  • 알려진 eukaryote, prokaryote, globin에 대해서는 Ready-Made riboPOOL을 제공합니다.
  • 실험에 사용되는 각종 buffer 및 component를 모아놓은 Kit로도 구매하실 수 있습니다.
  • 이외 목록에 없는 species의 경우에는 custom으로 제작해 드립니다.
  • polyadenylated and non-polyadenylated RNAs (e.g. long non-coding RNAs)에도 적용할 수 있습니다.
  • 2nmol(20rx), 5nmol(50rx), 10nmol(100rx) 사이즈로 제공됩니다.
  • Ribo-Zero (Illumina)에 비해 rRNA 제거율이 10% 이상 높습니다.


  • Ready-Made riboPOOL : 이미 검증된 species에 대한 riboPOOL (아래 표 참고)
  • Combination riboPOOL : 최대 4가지 species에 대한 riboPOOL을 고객이 원하는 ratio로 제공
  • Custom riboPOOL : 이미 검증된 species외에 고객이 원하는 종에 대한 riboPOOL 제작서비스
  • riboPOOL reaction kit : Ready-made riboPOOL을 포함하여 실험에 필요한 모든 시약 제공. 12, 24, 96 테스트 킷트 중 선택 가능.
    [킷트의 구성]
    1) riboPOOL
    2) nuclease-free water
    3) streptavidin-coated magnetic beads
    4) hybridization buffer
    5) depletion buffer
    6) ethanol precipitation reagents (linear acrylamide and 3M sodium acetate.)















 장내세균 ribosomal RNA의 효과적인 제거
  - RNA-sequencing, microarray, qPCR 실험에 방해가 되는 리보솜 RNA 제거
  - 미생물의 rRNA에 binding하는 biotinylated oligo mixture  
  - Streptavidin-coated magnetic bead를 이용하여 쉽게 분리 제거
  - 5S, 16S, 23S rRNA 타겟팅
  - 다양한 미생물을 커버하여 메타지노믹스/마이크로바이옴 분석에 용이 
  - Human & bacteria RNA 동시 분석시 콤비네이션 제작 가능 





주문정보(Ordering Information)
CATNUM PRODUCT SIZE
rdS10002Combination riboPOOL 1010 nmol
rdSKC1201Combination riboPOOL 12 reaction kit (up to 4 riboPOOLs)1 Kit
rdS02002Combination riboPOOL 22 nmol
rdSKC2401Combination riboPOOL 24 reaction kit (up to 4 riboPOOLs)1 Kit
rdS05002Combination riboPOOL 55 nmol
rdSKC9601Combination riboPOOL 96 reaction kit (up to 4 riboPOOLs)1 Kit
rdS10001riboPOOL 1010 nmol
rdSKH1201riboPOOL 12 reaction kit (human/mouse)1 Kit
rdSKO1201riboPOOL 12 reaction kit (other species/Pan-prokaryote/Globin)1 Kit
rdS02001riboPOOL 22 nmol
rdSKH2401riboPOOL 24 reaction kit (human/mouse)1 Kit
rdSKO2401riboPOOL 24 reaction kit (other species/Pan-prokaryote/Globin)1 Kit
rdS05001riboPOOL 55 nmol
rdSKH9601riboPOOL 96 reaction kit (human/mouse)1 Kit
rdSKO9601riboPOOL 96 reaction kit (other species/Pan-prokaryote/Globin)1 Kit
rdSTK0601riboPOOL Trial 6 reaction kit1 Kit