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riboPOOL 제작서비스 & riboPOOL kit

riboPOOL은 Biotinylated single stranded DNA probe mixture로, Ribosomal RNA를 depletion 함으로써, 중요한 의미를 갖는 RNA만 분리할 수 있습니다. 이렇게 rRNA가 제거된 농축된 RNA fraction은 NGS를 통해 Transcriptome profiling에 이용됩니다.

이미 검증된 species에 대해서는 Ready-made riboPOOL로 제공이 되며, 사용의 편리를 위하여 reaction kit로도 제공합니다.

그외의 species에 대해서는 custom service를 통해 제작을 요청하실 수 있습니다.

siTOOL
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  • riboPOOL은 NGS 분석을 위해 모든 리보좀 RNA를 제거하는 Biotinylated ssDNA probe mixture 입니다.
  • Ribo-Zero (Illumina)에 비해 제거효율이 높습니다.
  • 알려진 종에 대해 제작된 Ready-Made riboPOOL 및 고객이 원하는 종에 대한 Custom 제작이 가능합니다.
  • 미생물 (Pan-Prokaryote) riboPOOL은 장내세균 ribosomal RNA를 효과적으로 제거하여 마이크로바이옴 분석에 용이합니다.
  • 타겟 riboPOOL과 함께, 실험에 필요한 각종 시약을 Kit으로 제공합니다.


  • Ready-Made riboPOOL : 이미 검증된 species에 대한 riboPOOL 
   Eukaryotes  Prokaryotes  Abundant RNA
   A. queenslandica  Bacillus subtilis  Human Globin
   A. thaliana  C. crescentus  Poly A
   Aedes  C. perfringens  SARS-CoV-2 RNA
   C. elegans (deg)  E. coli  
   C. gigas  H. volcanii  
   Chinchila   P. aeruginosa  
   D. melanogaster  Pan-Actinobacteria  
   D. melanogaster (deg)  Pan-Archaea  
   Danio rerio  Pan-Bacteria  
   E. huxleyi  Pan-Pro   
   Fil. Fungi  Salmonella enterica  
   G. gallus  Stenotrophomonas sp.  
   human     
   Ixodes scapular    
   Loripes + Lucinoma    
   mouse/rat    
   Oryza sativa    
   Pan-Bird    
   Pan-Mammal    
   Pan-Plant     
   Pan-Sponge    
   Pichia pastoris    
   Plautia stali    
   S. aureus    
   S. cerevisiae    
   S. mediterranea    
   S. pombe    
   U. maydis    
       
  • Combination riboPOOL : 최대 4가지 species에 대한 riboPOOL을 고객이 원하는 ratio로 제공
  • Custom riboPOOL : 이미 검증된 species외에 고객이 원하는 종에 대한 riboPOOL 제작서비스
  • riboPOOL reaction kit : Ready-made riboPOOL을 포함하여 실험에 필요한 모든 시약 제공. 12, 24, 96 테스트 킷트 중 선택 가능.
    [킷트의 구성]
    1) riboPOOL
    2) nuclease-free water
    3) streptavidin-coated magnetic beads
    4) hybridization buffer
    5) depletion buffer
    6) ethanol precipitation reagents (linear acrylamide and 3M sodium acetate.)



















 장내세균 ribosomal RNA의 효과적인 제거
  - RNA-sequencing, microarray, qPCR 실험에 방해가 되는 리보솜 RNA 제거
  - 미생물의 rRNA에 binding하는 biotinylated oligo mixture  
  - Streptavidin-coated magnetic bead를 이용하여 쉽게 분리 제거
  - 5S, 16S, 23S rRNA 타겟팅
  - 다양한 미생물을 커버하여 메타지노믹스/마이크로바이옴 분석에 용이 
  - Human & bacteria RNA 동시 분석시 콤비네이션 제작 가능 





주문정보(Ordering Information)
CATNUM PRODUCT SIZE
rdS10002Combination riboPOOL 1010 nmol
rdSKC1201Combination riboPOOL 12 reaction kit (up to 4 riboPOOLs)1 Kit
rdS02002Combination riboPOOL 22 nmol
rdSKC2401Combination riboPOOL 24 reaction kit (up to 4 riboPOOLs)1 Kit
rdS05002Combination riboPOOL 55 nmol
rdSKC9601Combination riboPOOL 96 reaction kit (up to 4 riboPOOLs)1 Kit
rdS10001riboPOOL 1010 nmol
rdSKH1201riboPOOL 12 reaction kit (human/mouse)1 Kit
rdSKO1201riboPOOL 12 reaction kit (other species/Pan-prokaryote/Globin)1 Kit
rdS02001riboPOOL 22 nmol
rdSKH2401riboPOOL 24 reaction kit (human/mouse)1 Kit
rdSKO2401riboPOOL 24 reaction kit (other species/Pan-prokaryote/Globin)1 Kit
rdS05001riboPOOL 55 nmol
rdSKH9601riboPOOL 96 reaction kit (human/mouse)1 Kit
rdSKO9601riboPOOL 96 reaction kit (other species/Pan-prokaryote/Globin)1 Kit
rdSTK0601riboPOOL Trial 6 reaction kit1 Kit