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 제품안내  분자생물학   PCR Amplification

DNA 디자인 Software

일반 PCR, qPCR, Multiplex PCR등의 실험에 필요한 최적의 primer 및 probe 디자인을 편리하게 도와주는 DNA 전용 소프트웨어를 소개합니다.
DNA Software
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PanelPlex   Advanced multiplex PCR primer design s/w

  • 100 plex의 multiplex PCR primer를 design할 수 있는 소프트웨어
  • PCR 메카니즘과 에러원인을 파악하여 정확한 PCR primer 디자인 가능
  • 2차 구조와 hybridization 오류를 예견하는 향상된 알고리즘
  • 긴 시퀀스의 데이터베이스를 소화할 수 있는 클라우드 기반의 컴퓨팅 기술
  • ThermoBLAST 의 playlist를 이용하여 off-target hybridizations를 피한 디자인 가능:
    1) target 2차 구조로 인한 false negative
    2) 원치 않는 primer-primer interactions
    3) 잘못된 primer-amplicon interaction
    4) background genomes에서 증폭되는 경우
    5) Sequence variations으로 인한 low coverage
  • Multiplex PCR Primer 디자인 서비스도 가능합니다. (문의 : 고마바이오텍 02-579-8787)
                             
                                       

 

Visual OMP™   Multiplex PCR Primer Design Software
  • primer + probe design software for multiplex (up to 100 multiplex)
  • Nucleic acid 2차 구조의 folding 분석을 위한 플랫폼 기술
  • 다음과 같은 실험 디자인에 사용할 수 있음: Multiplex PCR, RT-PCR, qPCR, SNP detection, Microarrays, TaqMan, Beacons, Scorpions, RNAi, LATE-PCR, etc.
  • 실험 시뮬레이션이 가능하며, 시뮬레이션 결과를 바탕으로 실험 디자인을 optimization해서 실제 실험의 trial and error를 줄일 수 있음.  
  • Assay 조건에서 생성되는  target sequence의 secondary structure를 바탕으로  primer/probe가 잘 결합하는 부분을 선별할 수 있음
  • DNA, RNA, PNA, Morpholino, DNA Phosphorothioates, and 2'-O-Methyl sequence 모두 가능함.
  • Multiple primer과 probe을 동시에 할 수 있고 software algorithm이 의도하지 않는 crosshybridization 과 misshybridization 을 체크
  • 기존 실험에서 좋지 않은 결과를 가졌던 PCR target/primer를 입력하면 실험이 잘 안 된 원인을 분석해줌. (Fasta file형태로 software에 import가능)
  • Taqman probe와 Taqman Minor Groove Binder Probes를 모두 design할 수 있음.
  • Molecular beacons와 allele specific molecular beacon pairs 모두 design할 수 있음. 
  • Single SNP (Single-nucleotide polymorphism) site나 그 이상 차이나는 allele specific primers와 probes를 design할 수 있음.
  • RNA sequence의 실험 조건에서의 2차 구조도 예측할 수 있음.

        

PCR Pathfinder™   PCR Primer Design Software
  • Desktop primer + probe design software
  • End point PCR과 TaqMan assay에 사용되는 primer와 probe를 설계하는 기술
  • 사용이 간편한 마법사 구동 interface가 포함되어 있으며 최대 6개 multiplex를 설계할 수 있음. 

 

ThermoBLAST™   Improved BLAST
  • Cloud Based software
  • 기존 BLAST의 발전형
  • Complementarity v. similarity에 근거한 correct scoring
  • DNAS portal내의 게놈 데이터베이스에 대해 DNA 또는 RNA 서열을 빠르고 정확하게 스캔
  • 정확한 thermodynamic scoring을 산정으로 민감도와 특이성을 향상시켜 PCR 실험의 false positive 최소화 



CopyCount    qPCR Analysis Software
  • Cloud Based Software
  • qPCR실험의 absolute DNA Copy number를 제공
  • Standard curves를 필요로 하지 않음
  • Copy number variation, gene expression, viral load 실험에 적용
     
Free Trial이 필요하시면 연락주세요.
주문정보(Ordering Information)
CATNUM PRODUCT SIZE
PanelPlex™Advanced multiplex PCR primer design SoftwareEA
ThermoBLAST™ CEImproved BLASTEA
Visual OMP™Multiplex PCR Primer Design SoftwareEA
PCR Pathfinder™PCR Primer Design SoftwareEA
CopyCountqPCR Analysis SoftwareEA