DNA 디자인 Software


일반 PCR, qPCR, Multiplex PCR등의 실험에 필요한 최적의 primer 및 probe 디자인을 편리하게 도와주는 DNA 전용 소프트웨어를 소개합니다.
		DNA Software

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PanelPlex (New!)

Advanced multiplex PCR primer design

100 plex design 가능!
ThermoBLAST 의 playlist를 이용하여 off-target hybridizations를 피한 디자인 가능:
1) target 2차 구조로 인한 false negative
2) 원치 않는 primer-primer interactions
3) 잘못된 primer-amplicon interaction
4) background genomes에서 증폭되는 경우
5) Sequence variations으로 인한 low coverage
Cloud based software (6 개월~1년 license 제공)
Panelplex NGS (Next-Generation Sequencing) 서비스: NGS design의 경우 design 서비스로 제공 가능합니다.

Visual OMP™

Multiplex PCR Primer Design Software

primer + probe design software for multiplex (up to 100 multiplex)
Nucleic acid 2차 구조의 folding 분석을 위한 플랫폼 기술
다음과 같은 실험 디자인에 사용할 수 있음: Multiplex PCR, RT-PCR, qPCR, SNP detection, Microarrays, TaqMan, Beacons, Scorpions, RNAi, LATE-PCR, etc.
실험 시뮬레이션이 가능하며, 시뮬레이션 결과를 바탕으로 실험 디자인을 optimization해서 실제 실험의 trial and error를 줄일 수 있음.
Assay 조건에서 생성되는 target sequence의 secondary structure를 바탕으로 primer/probe가 잘 결합하는 부분을 선별할 수 있음
DNA, RNA, PNA, Morpholino, DNA Phosphorothioates, and 2'-O-Methyl sequence 모두 가능함.
Multiple primer과 probe을 동시에 할 수 있고 software algorithm이 의도하지 않는 crosshybridization 과 misshybridization 을 체크
기존 실험에서 좋지 않은 결과를 가졌던 PCR target/primer를 입력하면 실험이 잘 안 된 원인을 분석해줌. (Fasta file형태로 software에 import가능)
Taqman probe와 Taqman Minor Groove Binder Probes를 모두 design할 수 있음.
Molecular beacons와 allele specific molecular beacon pairs 모두 design할 수 있음.
Single SNP (Single-nucleotide polymorphism) site나 그 이상 차이나는 allele specific primers와 probes를 design할 수 있음.
RNA sequence의 실험 조건에서의 2차 구조도 예측할 수 있음.

PCR Pathfinder™

PCR Primer Design Software

ThermoBLAST™

Improved BLAST

CopyCount

qPCR Analysis Software

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