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 제품안내  항체,항원,킷트   Cancer Research  Epigenetics

CUTANA® CUT&Tag Assay

CUTANA® CUT&Tag Assay는 에피제네틱스 매핑을 위해 이용되는 방법으로, CUT&Tag은 Cleavage Under Targets and Tagmentation의 약자입니다.

Chromatin의 PTM 부분에 항체가 binding된 complex에 pAG-Tn5을 처리하여 sequencing adapter를 ligation시켜 tagging 합니다. 그후 chromatin을 조각낼 필요없이 바로 PCR 진행 후 시퀀싱을 수행할 수 있어 신속하고 편리합니다.

EpiCypher
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특징
  • 5000개 이하의 cell로 histone PTM을 profiling 할때 효과적입니다.
  • Chromatin fragmentation 및 DNA library를 만드는 과정이 생략됩니다.
  • ChIP-seq 대비 비용이 3배이상 절약됩니다.
  • 다양한 종의 항체를 사용할 수 있습니다. 

 

       (1) Nuclei 를 bead에 immobilized 시킵니다.
       (2) Primary & Secondary antibody와 histone PTM or Chromatin-interacting protein를 반응시킵니다.
       (3) pAG-Tn5 로 target-DNA complex를 분리하고 sequencing adapter를 ligation 시킵니다. 
       (4) PCR로 DNA를 증폭시키고, 바코드 adapter를 ligation 시킵니다.
       (5) NGS로 시퀀싱을 진행합니다.



  • CUTANA CUT&Tag 방법은 ChIP-seq에 비해 비용과 시간이 적게 듭니다.



  • 단 이틀내에 시퀀싱용 DNA가 준비됩니다.