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CUTANA™ CUT&RUN Assays

CUTANA pAG-MNase는 Chromatin Immunocleavage (ChIC), Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease (CUT&RUN) 방식에 이용되는 essential reagent로, 기존의 ChIP-Seq에 비해 적은 수의 cell 로도 분석이 가능하고, 시간이 단축되며, signal to noise ratio가 월등히 향상되어, Chromatin NGS에 효과적으로 이용될 수 있습니다.

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  • CUT&RUN 방식은 현재의 gold-standard 인 ChIP (chromatin immunoprecipitation)에 비해 훨씬 뛰어난 크로마틴 IP 결과를 제공합니다.
  • CUTANA pAG-MNase는 Epicypher사에서 출시한 CUT&RUN Assay 첫 제품으로, 항체와 결합된 PTM을 분리하기 위한 Proteins A/G와 Micrococcal Nuclease의 fusion construct reagent를 제공합니다.
  • Protein A/G를 이용하므로 다양한 항체 isotype을 분리할 수 있습니다.
  • 최소 300만 개의 시퀀싱 read를 통해 ChIP-seq에 대비 고품질의 데이터를 생성합니다.
  • high signal to noise로 결과 분석이 용이합니다.   

 


     1) lectin-coated 된 magnetic bead에 cell을 고정하고 permeabilization화 합니다.
     2) 크로마틴 타겟(ex: 히스톤 PTM 또는 크로마틴/DNA 결합 단백질)에 대한 항체를 반응시킵니다.
     3) CUTANA pAG-MNase를 처리하여 타겟 nucleosome을 잘라냅니다.
     4) CaCl2+를 넣으면 nucleosome complex가 유리됩니다.
     5) nucleosome complex로부터 DNA를 extraction하여 sequencing library를 준비한 후 (NGS)를 진행합니다.






              * Assay 방법별 차이점 보기










      Comparing data generated from standard ChIP-seq methods and sequencing depth (black) to CUTANA (blue).
      H3K27me3 and H3K4me3 ChIP-Seq data was sourced from ENCODE. Negative control data (yellow) was 
      generated using a Rabbit IgG antibody in CUTANA. Each dataset of CUTANA was acquired using 
      0.5 million cells.





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  CUTANA™ pAG-MNase for ChIC/CUT&RUN Workflows - 50 rxns (cat# 15-1016)
  • Type:  Nuclease
  • Host: E.coli
  • Mol Wgt: 44 kDa
  • Epitope Tag: 6His
  • Description : Recombinantly produced in E. coli, CUTANA™ pAG-MNase for ChIC/CUT&RUN Workflows is a fusion of Proteins A and G to Micrococcal Nuclease. This construct is useful in performing Chromatin Immunocleavage (ChIC) and Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease (CUT&RUN). CUTANA™ pAG-MNase contains a C-terminal 6xHis epitope tag.
  • Formulation : provided as a 20X stock in 10 mM Tris HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, and 50% glycerol.
  • Application : This product is sufficient to perform 50 CUT&RUN reactions. Recommended use: 2.5 μL of the supplied enzyme into a 50 μL CUT&RUN reaction (20X dilution).

 


주문정보(Ordering Information)
CATNUM PRODUCT SIZE
15-1016CUTANA™ pAG-MNase for ChIC/CUT&RUN50rx